El Fons Mallorquí ha establert convenis amb diverses entitats i institucions que permeten reforçar el treball dut a terme amb els països més desfavorits, a la vegada que creen vincles de col·laboració amb sectors de la societat que, d’aquesta manera, poden fer la seva aportació a la solidaritat internacional.

Conveni amb la Universitat de les Illes Balears
El 1997 se signà un conveni amb la UIB per treballar conjuntament en la cooperació al desenvolupament i donar suport a cursos i activitats del Centre de Formació per a la Cooperació (CFOC), integrat pel Fons Mallorquí i 25 ONG de Mallorca.

El 17 d’abril de 2007 se signà un conveni pel qual el Fons cedeix en dipòsit a la Universitat el seu fons bibliogràfic i el fons documental que conforma el seu arxiu corporatiu, corresponent al període comprès entre els anys 1993 i 2002. La cessió s’ha acordat amb la condició que els esmentats documents siguin posats permanentment a disposició del públic d’acord amb la normativa de funcionament dels serveis de la UIB, i a disposició permanent del propi Fons. Aquests fons documentals formaran part del Centre de Documentació en Cooperació al Desenvolupament que ha posat en marxa la UIB, amb el suport del Govern de les Illes Balears, i que té entre els seus objectius allotjar arxius d’institucions i entitats que treballen en el camp de la cooperació, per garantir-ne la conservació i facilitar-ne la consulta.

Conveni amb el Consell de Mallorca (Bombers de Mallorca) i Bombers sense Fronteres
Amb aquest conveni de 1997 es garanteix que el material de bombers que ja no compleix la normativa, però es troba en bon estat per poder ser utilitzat, sigui destinat a l’organització de cossos de bombers per a emergències a països del Sud.

Conveni amb l’Ajuntament de Palma (Bombers de Palma) i Bombers sense Fronteres
Signat el 12 de juny de 2005 entre el Fons Mallorquí de Solidaritat i Cooperació, el servei de Bombers de l’Ajuntament de Palma, i l’ONG Bombers sense Fronteres. La base d’aquest conveni és l’aprofitament del material que el servei de bombers renova quan ja no compleix la normativa vigent per al seu ús, però que encara és en bon estat i, per tant, útil en països on la normativa en permet l’utilització.

Segons el conveni, l’Ajuntament de Palma es compromet a reservar el material i assegurar el seu emmagatzematge. L’associació Bombers sense Fronteres és l’encarregada de revisar el material reservat, reparar-lo i preparar-lo per a la tramesa. El Fons Mallorquí assumeix el finançament dels enviaments, d’acord amb els projectes seleccionats i en la mesura de les possibilitats pressupostàries.

Conveni amb la Federació d’Entitats Locals de les Illes Balears (FELIB)
El 1996 es va signar aquest conveni on es manifestava la voluntat de col·laborar amb la solidaritat internacional i en la cooperació al desenvolupament, reconeixent al Fons Mallorquí com a instrument per dur-la a terme. Per la seva part la FELIB adquiria, entre altres, el compromís de recomanar els ajuntaments de Mallorca l’adhesió al Fons i donar difusió de la tasca que desenvolupa.